帶著烽煙卷土重來的恐龍帝國,再次威脅人類。感到須要借助真三一能萬俠來抗敵的隼人，匆忙趕到被政府接管的早乙女研究所。但可惜研究所卻早已受到恐龍帝國的襲擊。而它們的目標竟是破壞真三一萬能俠及暗殺早乙博士！就在隼人及號準備深入研究所內部的時候，敵方竟以倉庫內的試作型三一萬能俠突襲，千軍一發之際，滿身傷痕的龍馬突然出現！！而在這場賭上生命的戰斗中，三一萬能俠將發出全新的光輝！！！