幕末時期，維新派在傳奇的劊子手拔刀齋緋村劍心引退后，選出同樣具有高超劍術(shù)的志志雄真實繼續(xù)著暗殺任務(wù)。在維新即將獲得勝利之際，為掩蓋種種不可告人的秘密，新政府密謀殺害志志雄。誰知全身遭到重度燒傷的志志雄卻從地獄活轉(zhuǎn)，懷著巨大的仇恨制定了“京都破壞計劃”，他的手下網(wǎng)羅了四乃森蒼紫、瀨田宗次郎、宇水、張等一大批高手。與此同時，劍心、京都御庭番眾、齋藤、比谷清十郎紛紛行動起來，朝向京都進發(fā)。一場決定歷史命運的大戰(zhàn)即將拉開序幕……